甲硝唑，临床主要用于治疗或预防厌氧菌引起的系统或局部感染，如腹腔、消化道、女性生殖系、下呼吸道、皮肤及软组织、骨和关节等部位的厌氧菌感染，对败血症、心内膜炎、脑膜感染以及使用抗生素引起的结肠炎也有效；治疗破伤风常与破伤风抗毒素(TAT)联用；还可用于口腔厌氧菌感染。此外，甲哨唑具有杀灭疥虫及止痒作用，临床证明，确有良效。

患了疥疮可内服甲哨唑片，每次一片（0.2克），每日3次，大部分患者服药3-4天后瘙痒明显减轻，7天为一疗程，未愈可连续治第二个疗程，治疗期间应每日洗澡，消毒衣服。

用药期间可有食欲不振、恶心、呕吐等胃肠道反应，少数有腹泻。此外可偶见头痛、失眠、皮疹等。少数病例有膀胱炎、排尿困难、肢体麻木及感觉异常，停药后可迅速恢复。出现运动失调及其它中枢神经症状时应停药。